Pada hari yang tenang dan damai, langit terbelah dan makhluk ekstradimensi, yang disebut sebagai Yang Tidak Diketahui, meluncurkan serangan cepat dan brutal terhadap umat manusia. Untuk melindungi masa depan negara, semua anak Jepang dibekukan secara kriogenik sampai akhir perang untuk menjauhkan mereka dari bahaya. Beberapa tahun berlalu, dan umat manusia telah memantapkan pijakan di sudut Jepang, yang kini berfungsi sebagai garis depan perang. Tidak lagi menghadapi kepunahan umat manusia, anak-anak dibangunkan dari tidurnya. Kemudian ditemukan bahwa, sementara dalam cryogenesis, anak-anak telah mengembangkan Dunia, kekuatan supernatural yang unik untuk setiap orang. Enam anak terkuat diberi komando atas kota-kota yang direklamasi, menggunakan kekuatan mereka untuk mempertahankan benteng dari invasi yang terus berlanjut. Teman masa kecil Ichiya Suzaku dan Canaria Utara memimpin Tokyo, saudara kandung Kasumi dan Asuha Chigusa mengelola Chiba, dan Maihime Tenkawa serta Hotaru Rindou mengawasi Kanagawa. Seiring waktu, serangan yang hampir rutin dari Yang Tidak Diketahui dan bentrokan kepribadian para kepala kota dan wakilnya menumbuhkan persaingan kecil, yang mengarah ke pertengkaran terus-menerus antara ketiga kota tersebut. Dengan Unknown yang tiba-tiba meningkatkan tekanan serangan mereka, para pemimpin tiga kota harus belajar bagaimana bekerja sama atau berisiko kehilangan garis pertahanan terakhir melawan kepunahan umat manusia.
